Некоторое время назад после какого-то из апдейтов GOM Player перестал показывать субтитры в MKV-файлах. В других проигрывателях все было нормально. Оказалось, что GOM пытался отображать субтитры только своими внутренними кодеками. У него не получалось и субтитры плейер, никак не сигнализируя, решил не показывать. Лечение от такой нехорошей привычки, как «настройки по умолчанию» после апдейта, ищите в Preference -> Filter.

PS: Детская проблема и аналогичное решение. Но вот ведь вопрос, какие еще есть плейеры с автоматической генерацией плейлиста по имени файла? :-)